MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020530	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020530	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020530	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020530	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020530	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020530	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020530	TGA	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020530	ACAT	2	8	273	280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020530	TTAAAC	2	12	428	439	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020530	AAGA	2	8	507	514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020530	TA	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020530	CAT	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020530	GCT	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020530	TTC	2	6	828	833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020530	C	6	6	845	850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_020530	TCA	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455755
18	NC_020530	TAG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455755
19	NC_020530	ATT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455755
20	NC_020530	CTTA	2	8	1096	1103	25 %	50 %	0 %	25 %	472455755
21	NC_020530	ATC	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455755
22	NC_020530	GCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455755
23	NC_020530	CAT	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455755
24	NC_020530	T	7	7	1254	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
25	NC_020530	TGA	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455755
26	NC_020530	T	6	6	1461	1466	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
27	NC_020530	AAT	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455755
28	NC_020530	AGTA	2	8	1584	1591	50 %	25 %	25 %	0 %	472455755
29	NC_020530	TTC	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
30	NC_020530	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455755
31	NC_020530	TGT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455755
32	NC_020530	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
33	NC_020530	TTC	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
34	NC_020530	TAGA	2	8	1867	1874	50 %	25 %	25 %	0 %	472455755
35	NC_020530	AC	3	6	1890	1895	50 %	0 %	0 %	50 %	472455755
36	NC_020530	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
37	NC_020530	CCA	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455755
38	NC_020530	GC	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	472455755
39	NC_020530	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455755
40	NC_020530	AGT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455755
41	NC_020530	TCA	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455755
42	NC_020530	AGC	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455755
43	NC_020530	AC	3	6	2301	2306	50 %	0 %	0 %	50 %	472455755
44	NC_020530	CCAT	2	8	2321	2328	25 %	25 %	0 %	50 %	472455755
45	NC_020530	ATA	2	6	2357	2362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455755
46	NC_020530	ATT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455755
47	NC_020530	CTT	2	6	2424	2429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
48	NC_020530	ACA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472455755
49	NC_020530	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455755
50	NC_020530	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455755
51	NC_020530	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
52	NC_020530	TAG	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455755
53	NC_020530	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	472455755
54	NC_020530	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
55	NC_020530	TTC	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
56	NC_020530	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455755
57	NC_020530	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020530	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020530	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020530	CTT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020530	ACC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020530	CGTA	2	8	3200	3207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020530	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020530	AC	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020530	GTAA	2	8	3290	3297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020530	TTC	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020530	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020530	TCTT	2	8	3423	3430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020530	ATC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020530	TTCA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020530	ATTT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020530	TAT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020530	TCA	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020530	GCAA	2	8	3501	3508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020530	TGAA	2	8	3514	3521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020530	AAGT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020530	AACG	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020530	ATA	2	6	3597	3602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020530	AAT	2	6	3618	3623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020530	A	6	6	3629	3634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020530	TAAA	2	8	3681	3688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020530	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020530	ATT	2	6	3722	3727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020530	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020530	TGA	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020530	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020530	T	6	6	3829	3834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020530	TA	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020530	AAAT	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020530	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020530	ATA	2	6	3938	3943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020530	ATA	2	6	3950	3955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020530	TATT	2	8	3977	3984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020530	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455756
95	NC_020530	TTAA	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	472455756
96	NC_020530	TAT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455756
97	NC_020530	T	6	6	4257	4262	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
98	NC_020530	TTTA	2	8	4296	4303	25 %	75 %	0 %	0 %	472455756
99	NC_020530	AGC	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472455756
100	NC_020530	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
101	NC_020530	TAATT	2	10	4360	4369	40 %	60 %	0 %	0 %	472455756
102	NC_020530	GTT	2	6	4421	4426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472455756
103	NC_020530	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
104	NC_020530	TAT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455756
105	NC_020530	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472455756
106	NC_020530	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
107	NC_020530	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455756
108	NC_020530	TTGAAG	2	12	4649	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472455756
109	NC_020530	T	8	8	4746	4753	0 %	100 %	0 %	0 %	472455756
110	NC_020530	CAATTA	2	12	4814	4825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472455756
111	NC_020530	AAT	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455756
112	NC_020530	TAT	2	6	4921	4926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
113	NC_020530	AAG	2	6	4937	4942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455757
114	NC_020530	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
115	NC_020530	TTA	2	6	5005	5010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
116	NC_020530	T	6	6	5011	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
117	NC_020530	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455757
118	NC_020530	TC	3	6	5114	5119	0 %	50 %	0 %	50 %	472455757
119	NC_020530	TAA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455757
120	NC_020530	AAT	2	6	5140	5145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455757
121	NC_020530	AAGT	2	8	5163	5170	50 %	25 %	25 %	0 %	472455757
122	NC_020530	CATAA	2	10	5185	5194	60 %	20 %	0 %	20 %	472455757
123	NC_020530	ACC	2	6	5197	5202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472455757
124	NC_020530	ATA	2	6	5258	5263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455757
125	NC_020530	TTA	2	6	5291	5296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
126	NC_020530	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
127	NC_020530	A	7	7	5375	5381	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
128	NC_020530	GATAC	2	10	5389	5398	40 %	20 %	20 %	20 %	472455757
129	NC_020530	A	8	8	5416	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
130	NC_020530	AT	3	6	5481	5486	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
131	NC_020530	AT	3	6	5538	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
132	NC_020530	TCT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472455757
133	NC_020530	TAT	3	9	5613	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
134	NC_020530	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	472455757
135	NC_020530	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472455757
136	NC_020530	TAT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472455757
137	NC_020530	T	6	6	5770	5775	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
138	NC_020530	AT	3	6	5783	5788	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
139	NC_020530	CATT	2	8	5794	5801	25 %	50 %	0 %	25 %	472455757
140	NC_020530	AGA	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455757
141	NC_020530	TTAA	2	8	5833	5840	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
142	NC_020530	AAG	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472455757
143	NC_020530	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	472455757
144	NC_020530	AATT	2	8	5873	5880	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
145	NC_020530	T	6	6	5904	5909	0 %	100 %	0 %	0 %	472455757
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166	NC_020530	AAG	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_020530	TA	3	6	7323	7328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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